Pociągi jadące z Wieliczki do Krakowa mogą mieć nawet godzinne opóźnienie, podobnie jest ze składami z Oświęcimia. Poranny pociąg z Tarnowa, który miał być planowo o 7:37, dojechał na Dworzec Główny w Krakowie z półgodzinnym opóźnieniem.

Problemy mogą też mieć pociągi Intercity. Niektóre składy mogą być odwoływane.